ミュンヘン市は市内の道路交通混雑の対応策として、当初はフランクフルトやケルンと同様、既存の路面電車路線の都心部分を地下化することを検討していたが、その後、より抜本的な対策として、本格的な地下鉄を建設することとした。地下鉄を運営するMVGは、ミュンヘン市が100％の株式を保有する会社で他に路面電車やバスも運営しているが、運営費の４割以上は国、州及び市からの補助金で賄われている。1971年以降、MVGはミュンヘン市とその周辺地域の交通事業者と共に、ミュンヘン運輸・運賃連合（MVV）を結成し、共通運賃・共通乗車券制度を採用している。
最初の開業は、翌年に夏季オリンピック開催を控えた1971年10月、U6号線のKieferngarten ～ Goetheplatz 間、続いて1972年５月、U3号線のMünchner Freiheit ～ Olympiazentrum（オリンピックセンター）間である。これと同時期にドイツ鉄道の子会社が運営するSバーンの市中心部を貫く地下路線も開業し、これが今日ミュンヘンが地下鉄網の充実した都市のひとつに発展する出発点となった。現在ミュンヘンでは、地下鉄路線とSバーンの路線とによる効率的なネットワークが市内ほぼ全域をカバーしている。地下鉄路線のうち、U1とU2、U3とU6、U4とU5号線は、都心部でそれぞれ同一線路を共用している。なお、U7とU8は、混雑時のみ他路線上をまたいで運行する系統である。
全線で自動制御によるワンマン運転を実施しているが、ホームドアは設けられておらず、監視カメラにより制御室から監視している。MVVは定時運行の確保率が非常に高く、市内ゾーンで20分以上遅延した場合には、10日以内に申請すれば１日フリーパス相当の6.2ユーロが、また、乗換の最終電車に間に合わなかった場合には25ユーロを限度にタクシー代が支払われる。
将来計画としては、U6が南方へ建設中であり、U4を東方へ、U5を西方へそれぞれ延伸される計画がある。